Homem de muitas posses, coronel Desidério José de Souza comprou uma fazenda na segunda metade do século XIX e deu início à povoação que hoje leva o seu nome. Na fazenda dele, as pessoas se reuniam em festas religiosas a fim de realizar casamentos e batizados e seu Desidério mandava buscar um padre para os eventos. Além disso, ele incentivou a construção de casas na região.
No último dia 22 de fevereiro, o povoado iniciado pelo coronel completou 49 anos de emancipação político-administrativa, data que foi lembrada na Assembleia Legislativa pelo deputado Herbert Barbosa (DEM), em moção de congratulações.
De acordo com o parlamentar, um grande impulso para a emancipação de São Desidério foi o desmembramento de vários municípios da região oeste. "Em 10 de abril de 1895, através do ato do governador Joaquim Manoel Rodrigues, São Desidério foi elevado à condição de distrito de Barreiras", contou Herbert, acrescentando que, a partir da segunda metade do século XX, várias pessoas se destacaram na luta pela emancipação, como José Alves Ribeira Sobrinho (Cazuza), Heliodoro Ribeiro e Abelardo Alencar.
Finalmente, em 2 de fevereiro de 1962, através do Decreto-Lei Estadual nº 1.621 do governador Lomanto Júnior, São Desidério foi desmembrado de Barreiras e virou município. Com a emancipação, São Desidério ficou com um imenso território, perfazendo uma área de 14.819 km². Tem limites com as cidades de Luís Eduardo Magalhães, Barreiras, Baianópolis, Santa Maria da Vitória, Catolândia e com os estados de Tocantins e Goiás. Atualmente, possui uma população de aproximadamente 28 mil habitantes.
O patrimônio natural de São Desidério reserva às pessoas que se interessam por turismo ecológico um significativo parque hídrico, como a Lagoa Azul, a Gruta do Catão, a Gruta do Buraco do Inferno e as Grutas das Pedras Brilhantes. Além desses, o deputado Herbert Barbosa citou o Sumidouro, que é um lago subterrâneo, o Rio Grande, o Paredão do Deus me Livre, além de muitas cavernas encravadas em despenhadeiros de pedras, "formando belíssimos poços e piscinas naturais, complementadas por uma fauna e flora exuberantes".